Odběr vzorků na DNA analýzy
Proč je užitečné správně odebírat vzorky?
- Nález trusu, moči nebo chlupů velkých šelem je poměrně vzácná událost. Odběr vzorku zabere několik minut a je zcela klíčový pro úspěšnost izolace DNA.
- Na základě analýz DNA lze zjistit například pohlaví zvířete a jeho zdrojovou populaci, v případě většího množství vzorků rozlišit konkrétní jedince, zjistit jejich příbuzenské vztahy, a genetickou diverzitu (která souvisí se stupněm izolace příslušné populace), což jsou informace mnohem detailnější a z hlediska ochrany druhů zajímavější než zjištění založená pouze na dokumentaci pobytových stop.
Orientační rozlišení jednotlivých druhů podle trusu:
Rys – válečky kolem 2,5 cm, hmota z chlupů, bez rostlinné složky, často zahrabává
Vlk – válečky kolem 3 cm, plný chlupů a kostí, u smeček větší kupa, viditelné místo
Možnost záměny: liška: 2-2,5 cm, chlupy, kosti může být i rostlinná složka, většinou výrazně zašpičatělý konec, ukládá na viditelné místo
Medvěd: velmi rozmanitý trus (3-6 cm dlouhý válec, nepravidelná hromada, lejno podobné kravskému), často rozpoznatelné zbytky semen, lesních plodů, krovek brouků apod.
Možnost záměny: divoké prase – válce složené z menších hrudek, stářím se rozpadají, trus výrazněji páchne
Sběr trusu
-
Smysluplné je pro účely DNA analýz sbírat jen čerstvý trus - max. 3 (v zimě 5) dny starý (ještě vlhký).
Foto: L. Kutalová
- Předtím, než vzorek začnete odebírat, zhodnoťte, jaká je pravděpodobnost že se jedná o sledovanou velkou šelmu, také na základě stop v okolí.
- Odběr vzorku provedet nejsnáze pomocí na místě seříznutých klacíků: odeberte segment trusu (většinou konec, obsahující slizkou část (důležité jsou buňky střevní sliznice) a uložte do zkumavky s 96 % lihem (na vyžádání zašleme). V případě několika dnů starého trusu, na nějž působilo slunce nebo déšť vhodnější odebrat ze spodní strany trusu.
Kresba: T. Skrbinšek
- Nedotýkejte se ústí otevřené zkumavky a dejte pozor, aby nedošlo ke kontaminaci vzorku lidskou DNA (mikroskopické šupinky kůže obsahují genetický materiál) – nesahejte ani na odbírací konce klacíků;
- Vzorek by měl naplnit max. 1/2 objemu zkumavky, aby byl v každé poloze lahvičky vždy ponořený.
- Zkumavku řádně označte štítkem pospaným obyčejnou tužkou nebo si poznamenejte její již přidělené číslo do databáze.
- Co nejdříve vzorek uložte do chladu – nejlépe do mrazáku nebo alespoň do lednice.
- V případě, že nemáte k dispozici líh, vzorek je možné zmrazit (-20°C). Poté je ale potřeba se vyvarovat častého rozmrazování a zamrazování vzorku (způsobuje degradaci DNA).
- Nalezený trus je také vhodné zdokumentovat (vyfotit s měřítkem) v celku a zbytek trusu sebrat na rozbory potravy či parazitů.
- Pokud najdete trus na cestě, odstraňte zbytek trusu (nebo ukryjte) tak, aby nemohl být sebrán jiným mapovatelem jako duplicitní vzorek.
Sběr moči ze sněhu
- Odeberte pomočený sníh do lahvičky s lihem a nakládejte s ní stejně jako v když najdete trus.
Foto: L. Kutalová
Sběr chlupů
- Chlupy lze nalézt na sněhu (vyležená místa), na trčících kmenech nebo pařezech (rys se o ně často drbává).
- Odeberte je jen do papírové obálky nebo do složeného listu papíru. Nejdůležitější je bazální část chlupu (cibulka), nemá proto smysl sbírat jen krátké úlomky chlupů. Papírový sáček vložte do igelitového s několika kuličkami vysoušeče vzduchu – silikagelu (odstraňuje vlhkost, která snižuje úspěšnost DNA analýz).
Rysí srst zachycená na pahýlu stromu. Foto: L. Kutalová
Další využití nálezů trusu
Kromě odběru části vzorku na DNA analýzu je v případě nálezu trusu vhodné odebrat celý vzorek (nebo několik segmentů) na další analýzy. Stačí, když celý vzorek zamrazíte. Spolupracující instituce (VFU v Brně, Parazitologický ústav AVČR v Českých Budějovicích, Masarykova univerzita v Brně) trus využívají pro parazitologické a virologické vyšetření a potravní analýzy.
MIROSLAV KUTAL, PAVEL HUVLA, BARBORA TURBAKOVÁ
